Regardez ce qu'il y a à l'intérieur de ce que vous lisez en ligne. Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité (2016) RTF,FB2,EPUB,MOBI. Nez et poumons

Livre:«Regarde ce qu'il y a en toi. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité"

Nom d'origine: Suis ton instinct. L’énorme impact des minuscules microbes

Dehors: 2015

Éditeur: Corpus

Langue: Russe (traduit de l'anglais)

A propos de l'auteur

Rob Knight est un célèbre microbiologiste, l'un des pionniers dans le domaine de l'étude des microbes vivant dans le corps humain. Professeur de pédiatrie, directeur du laboratoire de microbiologie de l’Université de Californie à San Diego, co-fondateur des projets de recherche américains sur le microbiome intestinal et terrestre – toutes les références et réalisations de Knight sont difficiles à énumérer. En tant que journaliste scientifique, il écrit la chronique IAmA sur Reddit, où il répond aux questions des utilisateurs sur les microbes et écrit des livres divertissants sur ses sujets. Un scientifique sérieux avec un don pour l’écriture – que demander de plus ?

À propos du livre

C'est donc un livre de la série TED Books. La série est basée sur les conférences du célèbre projet éducatif TED - la lecture de ces livres complétera très bien l'écoute des conférences, nous vous recommandons de l'essayer. Et, par conséquent, l'auteur du livre est l'un des conférenciers TED.

Rob Knight soutient que chaque personne devrait être considérée comme un écosystème en soi, dans lequel vivent des milliards de microbes. Le livre parle de la proximité de milliers de variétés de microbes - les microbes de la main gauche ne font qu'un, et ceux de droite sont différents, et les microbes de la bouche ne s'installeront jamais dans les narines (oui !). Ou, par exemple. J’ai aimé ce postulat : « les créatures microbiennes sur les mains des femmes, en règle générale, sont plus diverses que sur celles des hommes, et cette différence persiste, même malgré le lavage des mains. »

Rob et un groupe de scientifiques sont allés plus loin que d'autres chercheurs : ils proposent de blâmer les microbes pour les sautes d'humeur, prédéterminant nos préférences et façonnant notre personnalité ! C'est pourquoi les experts recommandent d'apprendre dès que possible, sinon de contrôler, puis d'interagir avec ces petites créatures.

À propos de la publication

On rencontre le livre par sa jaquette - lumineuse, mate avec des rayures noires brillantes, c'est un plaisir de tenir et de feuilleter un tel livre. Nous avons eu un différend avec le journal à la rédaction : il a le goût, l'odeur et la couleur du papier couché, mais dans le livre il est indiqué qu'il est offset. Dans l'ensemble, c'est un bon article.

Le format du livre est pratique pour voyager en métro pour se rendre au travail et revenir - seulement 76x108 mm. Certes, cela ne durera pas longtemps, mais ici nous allons vous faire plaisir : la maison d'édition Corpus a déjà publié trois autres livres dans cette série. Collectionnez tout !

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Nom: Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité (2016) RTF,FB2,EPUB,MOBI

Année de sortie: 2016

Éditeur: Corpus (AST)

Format: RTF,FB2,EPUB,MOBI

Déposer: SmotriVnytri.rar

Taille: 10,3 Mo

Description du livre "Téléchargement gratuit Regardez ce qu'il y a à l'intérieur de vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité (2016) RTF,FB2,EPUB,MOBI"

Description: Nous vivons à une époque de véritable révolution en microbiologie. Les dernières technologies ont permis aux scientifiques de s'immerger dans le monde des créatures microscopiques qui habitent notre corps et de faire des découvertes étonnantes dans ce monde. Il s'avère que les microbes, qui vivent en quantités incroyables dans presque tous les recoins de notre corps, jouent un rôle bien plus important qu'on ne le pensait auparavant : non seulement notre santé physique en dépend, mais ils déterminent notre humeur, nos goûts et notre personnalité même. . Nous sommes personnellement informés de ces avancées scientifiques : l'auteur du livre, Rob Knight, est l'un des principaux microbiologistes modernes, créant sous nos yeux la science du futur.

Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité Rob Chevalier

(Pas encore de notes)

Titre : Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité
Auteur : Rob Knight
Année : 2015
Genre : Médecine, Autre littérature pédagogique, Littérature pédagogique étrangère

À propos du livre « Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité - Rob Knight

Nous vivons à une époque de véritable révolution en microbiologie. Les dernières technologies ont permis aux scientifiques de s'immerger dans le monde des créatures microscopiques qui habitent notre corps et de faire des découvertes étonnantes dans ce monde. Il s'avère que les microbes, qui vivent en quantités incroyables dans presque tous les recoins de notre corps, jouent un rôle bien plus important qu'on ne le pensait auparavant : non seulement notre santé physique en dépend, mais ils déterminent notre humeur, nos goûts et notre personnalité même. . Nous sommes personnellement informés de ces avancées scientifiques : l'auteur du livre, Rob Knight, est l'un des principaux microbiologistes modernes, créant sous nos yeux la science du futur.

Sur notre site consacré aux livres, vous pouvez télécharger le site gratuitement sans inscription ou lire en ligne le livre « Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité" Rob Knight aux formats epub, fb2, txt, rtf, pdf pour iPad, iPhone, Android et Kindle. Le livre vous procurera de nombreux moments agréables et un réel plaisir de lecture. Vous pouvez acheter la version complète auprès de notre partenaire. Vous trouverez également ici les dernières nouvelles du monde littéraire, découvrez la biographie de vos auteurs préférés. Pour les écrivains débutants, il existe une section séparée avec des trucs et astuces utiles, des articles intéressants, grâce auxquels vous pouvez vous-même vous essayer à l'artisanat littéraire.

Citations du livre « Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité - Rob Knight

La communauté microbienne sur votre main est très différente des communautés similaires d'autres personnes (en termes de diversité des espèces - en moyenne de 85 %), ce qui signifie que chacun de nous, en plus des empreintes digitales habituelles, a également des empreintes microbiennes.

De plus, nous avons découvert que les microbes qui vivent sur votre main gauche sont différents de ceux qui vivent sur votre droite. Vous pouvez vous frotter les mains, taper dans vos mains et toucher les mêmes surfaces avec les deux mains : chacun développera toujours une communauté microbienne distincte.

Les microbes qui vivent sur notre peau – comme tous les autres microbes – n’existent pas nécessairement spécifiquement pour notre bénéfice. Mais eux, en tant que résidents consciencieux, nous aident vraiment beaucoup : du simple fait qu'ils vivent sur nous, ils empêchent d'autres microbes nocifs de nous infecter.

Regardez ce qu'il y a en vous. Comment les microbes vivant dans notre corps déterminent notre santé et notre personnalité

L’énorme impact des minuscules microbes

ROB CHEVALIER

AVEC BRENDAN BUHLER

TED, le logo TED et TED Books sont des marques commerciales de TED Conferences, LLC

TED BOOKS et colophon sont des marques déposées de TED Conferences, LLC

Couverture et design intérieur par MGMT. conception Illustrations par Olivia de Salve Villedieu

© 2015 par Rob Livre. Tous droits réservés.

© E. Valkina, traduction en russe, 2015

© Maison d'édition AST LLC, 2015

Maison d'édition CORPUS ®

À mes parents, Alison et John, avec gratitude pour leurs gènes, leurs idées et leurs microbes

Nous savons qui vous êtes : un être humain, un animal à deux pattes aux possibilités d'esprit infinies, héritier de toutes choses, qui n'a jamais lu entièrement un seul contrat d'utilisation - il vous suffit de cocher la bonne case. Maintenant, rencontrez-moi, c'est vous aussi : des milliards de petites créatures vivant dans vos yeux, vos oreilles et de vastes domaines appelés vos intestins. Et ce microcosme intérieur peut changer votre compréhension de vos maladies, de votre santé et de vous-même.

Grâce aux nouvelles technologies (dont beaucoup ont été développées ces dernières années), les scientifiques en savent désormais plus que jamais sur les formes de vie microscopiques qui se trouvent à l’intérieur de nous. Et ce que nous apprenons est incroyable. Ces organismes unicellulaires - les microbes - se sont révélés non seulement beaucoup plus nombreux que nous le pensions, mais ils vivent en quantités incroyables dans presque tous les coins de notre corps et jouent un rôle bien plus important que nous ne pourrions jamais l'imaginer : tant d'aspects de notre vie, notre santé et même notre personnalité en dépendent.

L’ensemble des créatures microscopiques auxquelles notre corps sert de foyer s’appelle le microbiote humain (parfois aussi la microflore et la microfaune), et l’ensemble de leurs gènes est le microbiome humain. Et, comme cela arrive souvent avec les découvertes scientifiques, de nouveaux faits sur le micromonde nous obligent à humilier notre ego. L'astronomie nous a déjà expliqué que notre planète n'est pas du tout le centre de l'Univers ; l'évolution nous a appris que l'homme n'est qu'une espèce animale parmi d'autres. La cartographie du microbiome humain nous enseigne que dans la maison de notre corps, notre propre voix est noyée dans un chœur de formes de vie indépendantes (et interdépendantes) avec leurs propres aspirations et agendas.

Combien de micro-organismes y a-t-il en nous ? Vous êtes constitué d’environ dix mille milliards de cellules humaines, mais votre corps contient environ cent mille milliards de cellules microbiennes. Autrement dit, vous n’êtes, dans une large mesure, pas vous.

Mais cela ne signifie pas qu'une personne n'est qu'un conteneur pour de minuscules créatures qui pénètrent accidentellement dans son corps et propagent des maladies. En fait, nous vivons en équilibre avec toute la communauté de micro-organismes qui nous habitent. Leur rôle ne se limite pas à celui de passagers passifs : ils participent à des processus vitaux fondamentaux, notamment la digestion, les réponses immunitaires et même le comportement.

La collection de microbes en nous représente quelque chose comme un amalgame de différentes communautés. Différents groupes d’espèces habitent différentes parties du corps, chacune ayant des fonctions spécialisées. Les microbes qui vivent dans la bouche sont différents de ceux qui vivent sur la peau ou dans les intestins. Nous ne sommes pas seulement des individus ; chacun de nous est un écosystème.

La diversité des micro-organismes contribue à expliquer même les caractéristiques individuelles que nous avons l’habitude d’attribuer au hasard ou à la malchance. Disons pourquoi certains d'entre nous aiment tant les moustiques ? Par exemple, ces petits démons me mordent à peine, alors qu'ils volent vers mon amie Amanda comme des abeilles vers le miel. Il s'avère que certains d'entre nous vraiment a meilleur goût pour les moustiques, et la principale raison de cet « appétit » sélectif réside dans les différences dans la composition des communautés microbiennes qui vivent sur notre peau (plus de détails à ce sujet dans le chapitre 1).

Et ce n’est pas tout : la variété des microbes qui vivent sur et en nous est tout simplement étonnante. Vous avez probablement entendu dire que, comparé à l'ADN, nous, les humains, sommes tous à peu près pareils : notre génome est identique à 99,99 % à celui de toute autre personne, par exemple votre voisin. Mais cela ne s’applique pas à la microflore de vos intestins : seulement 10 % des microbes peuvent être identiques.

Cela peut expliquer les énormes différences entre les gens - des différences de poids aux allergies différentes, de la probabilité de tomber malade au niveau d'anxiété. Nous commençons tout juste à systématiser – et à comprendre – ce vaste microcosme, mais les conclusions des premières études sont déjà stupéfiantes.

La diversité infinie du monde microbien est particulièrement impressionnante si l’on considère qu’il y a quarante ans à peine, nous n’avions aucune idée du nombre d’organismes unicellulaires et du nombre incroyable d’espèces qu’ils contiennent. Avant cela, les principes de base de la classification des organismes vivants étaient basés sur le livre de Charles Darwin « L'origine des espèces », publié en 1859. Darwin a représenté un arbre de l'évolution, regroupant tous les organismes selon des caractéristiques physiques communes : pinsons à bec court, pinsons à long bec, etc. ; et ce principe resta longtemps la base de la classification et de la taxonomie.

Les idées traditionnelles sur la vie étaient basées sur ce que les gens pouvaient voir dans le monde qui les entourait – à l’œil nu ou au microscope. Les organismes plus grands étaient divisés en plantes, animaux et champignons. Les organismes unicellulaires restants se répartissaient en deux grandes catégories : les protistes (protozoaires) et les bactéries. En ce qui concerne les plantes, les animaux et les champignons, nous avions raison. Mais nos idées sur les organismes unicellulaires se sont révélées complètement erronées.

En 1977, les microbiologistes américains Carl Woese et George E. Fox ont proposé une nouvelle version de « l'arbre de vie », basée sur une comparaison de différentes formes de vie au niveau cellulaire en utilisant l'acide ribonucléique ribosomal, un parent de l'ADN présent dans chaque cellule et participe à la synthèse des protéines. La photo était magnifique. Woese et Fox ont découvert que les organismes unicellulaires sont plus diversifiés que toutes les plantes et tous les animaux réunis. Il s’est avéré que ce sont des animaux, des plantes, des champignons ; tout le monde, méduses, bousiers ; n'importe quel fil d'algue, n'importe quelle parcelle de mousse, les séquoias de Californie qui s'élèvent vers le haut ; tous les lichens et champignons forestiers - tous les êtres vivants que nous voyons autour - ne sont que trois processus à l'extrémité d'une branche de l'arbre évolutif. Ses principaux habitants sont des organismes unicellulaires : bactéries, archées (qui ont été identifiées pour la première fois comme un groupe distinct par Woese et Fox), levures et quelques autres formes de vie.

Ce n’est qu’au cours des dernières années qu’il y a eu une percée dans la compréhension de la microvie en nous, que nous devons aux nouvelles technologies, notamment à l’amélioration du séquençage de l’ADN et à l’explosion de la puissance des ordinateurs. Aujourd'hui, grâce à un processus appelé séquençage de nouvelle génération, nous pouvons prélever des échantillons de cellules de différentes parties du corps, analyser rapidement l'ADN microbien qu'elles contiennent, le comparer et le combiner avec des informations provenant d'autres organes, pour identifier les milliers d'espèces de micro-organismes. qui habitent notre corps. . Nous découvrons ainsi des bactéries, des archées, des levures et d'autres organismes unicellulaires (notamment les eucaryotes) dont les génomes combinés sont plus longs que le nôtre.

L’énorme impact des minuscules microbes

ROB CHEVALIER

AVEC BRENDAN BUHLER

TED, le logo TED et TED Books sont des marques commerciales de TED Conferences, LLC

TED BOOKS et colophon sont des marques déposées de TED Conferences, LLC

Couverture et design intérieur par MGMT. conception Illustrations par Olivia de Salve Villedieu

© 2015 par Rob Livre. Tous droits réservés.

© E. Valkina, traduction en russe, 2015

© Maison d'édition AST LLC, 2015

Maison d'édition CORPUS ®

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À mes parents, Alison et John, avec gratitude pour leurs gènes, leurs idées et leurs microbes

Préface

Nous savons qui vous êtes : un être humain, un animal à deux pattes aux possibilités d'esprit infinies, héritier de toutes choses, qui n'a jamais lu entièrement un seul contrat d'utilisation - il vous suffit de cocher la bonne case. Maintenant, rencontrez-moi, c'est vous aussi : des milliards de petites créatures vivant dans vos yeux, vos oreilles et de vastes domaines appelés vos intestins. Et ce microcosme intérieur peut changer votre compréhension de vos maladies, de votre santé et de vous-même.

Grâce aux nouvelles technologies (dont beaucoup ont été développées ces dernières années), les scientifiques en savent désormais plus que jamais sur les formes de vie microscopiques qui se trouvent à l’intérieur de nous. Et ce que nous apprenons est incroyable. Ces organismes unicellulaires - les microbes - se sont révélés non seulement beaucoup plus nombreux que nous le pensions, mais ils vivent en quantités incroyables dans presque tous les coins de notre corps et jouent un rôle bien plus important que nous ne pourrions jamais l'imaginer : tant d'aspects de notre vie, notre santé et même notre personnalité en dépendent.

L’ensemble des créatures microscopiques auxquelles notre corps sert de foyer s’appelle le microbiote humain (parfois aussi la microflore et la microfaune), et l’ensemble de leurs gènes est le microbiome humain. Et, comme cela arrive souvent avec les découvertes scientifiques, de nouveaux faits sur le micromonde nous obligent à humilier notre ego. L'astronomie nous a déjà expliqué que notre planète n'est pas du tout le centre de l'Univers ; l'évolution nous a appris que l'homme n'est qu'une espèce animale parmi d'autres. La cartographie du microbiome humain nous enseigne que dans la maison de notre corps, notre propre voix est noyée dans un chœur de formes de vie indépendantes (et interdépendantes) avec leurs propres aspirations et agendas.

Combien de micro-organismes y a-t-il en nous ? Vous êtes constitué d’environ dix mille milliards de cellules humaines, mais votre corps contient environ cent mille milliards de cellules microbiennes. 1
Il convient de noter que le dernier rapport de l’Académie américaine de microbiologie réduit ce ratio à 3 : 1, principalement en raison d’une augmentation du nombre de cellules humaines dénombrées.

Mais de toute façon, la supériorité numérique est du côté des microbes. Voir : http://academy.asm.org/index.php/faq-series/5122humanmicrobiome.

Mais cela ne signifie pas qu'une personne n'est qu'un conteneur pour de minuscules créatures qui pénètrent accidentellement dans son corps et propagent des maladies. En fait, nous vivons en équilibre avec toute la communauté de micro-organismes qui nous habitent. Leur rôle ne se limite pas à celui de passagers passifs : ils participent à des processus vitaux fondamentaux, notamment la digestion, les réponses immunitaires et même le comportement.

La collection de microbes en nous représente quelque chose comme un amalgame de différentes communautés. Différents groupes d’espèces habitent différentes parties du corps, chacune ayant des fonctions spécialisées. Les microbes qui vivent dans la bouche sont différents de ceux qui vivent sur la peau ou dans les intestins. Nous ne sommes pas seulement des individus ; chacun de nous est un écosystème.

La diversité des micro-organismes contribue à expliquer même les caractéristiques individuelles que nous avons l’habitude d’attribuer au hasard ou à la malchance. Disons pourquoi certains d'entre nous aiment tant les moustiques ? Par exemple, ces petits démons me mordent à peine, alors qu'ils volent vers mon amie Amanda comme des abeilles vers le miel. Il s'avère que certains d'entre nous vraiment a meilleur goût pour les moustiques, et la principale raison de cet « appétit » sélectif réside dans les différences dans la composition des communautés microbiennes qui vivent sur notre peau (plus de détails à ce sujet dans le chapitre 1).

Et ce n’est pas tout : la variété des microbes qui vivent sur et en nous est tout simplement étonnante. Vous avez probablement entendu dire que, comparé à l'ADN, nous, les humains, sommes tous à peu près pareils : notre génome est identique à 99,99 % à celui de toute autre personne, par exemple votre voisin. Mais cela ne s’applique pas à la microflore de vos intestins : seulement 10 % des microbes peuvent être identiques.

Cela peut expliquer les énormes différences entre les gens - des différences de poids aux allergies différentes, de la probabilité de tomber malade au niveau d'anxiété. Nous commençons tout juste à systématiser – et à comprendre – ce vaste microcosme, mais les conclusions des premières études sont déjà stupéfiantes.

La diversité infinie du monde microbien est particulièrement impressionnante si l’on considère qu’il y a quarante ans à peine, nous n’avions aucune idée du nombre d’organismes unicellulaires et du nombre incroyable d’espèces qu’ils contiennent. Avant cela, les principes de base de la classification des organismes vivants étaient basés sur le livre de Charles Darwin « L’origine des espèces », publié en 1859. 2
Disponible en ligne : Projet Gutenberg, www.gutenberg.org/files/1228/1228-h/1228-h.htm.

Darwin a représenté un arbre de l'évolution, regroupant tous les organismes selon des caractéristiques physiques communes : pinsons à bec court, pinsons à long bec, etc. ; et ce principe resta longtemps la base de la classification et de la taxonomie.

Les idées traditionnelles sur la vie étaient basées sur ce que les gens pouvaient voir dans le monde qui les entourait – à l’œil nu ou au microscope. Les organismes plus grands étaient divisés en plantes, animaux et champignons. Les organismes unicellulaires restants se répartissaient en deux grandes catégories : les protistes (protozoaires) et les bactéries. En ce qui concerne les plantes, les animaux et les champignons, nous avions raison. Mais nos idées sur les organismes unicellulaires se sont révélées complètement erronées.

En 1977, les microbiologistes américains Carl Woese et George E. Fox ont proposé une nouvelle version de « l'arbre de vie », basée sur une comparaison de différentes formes de vie au niveau cellulaire en utilisant l'acide ribonucléique ribosomal, un parent de l'ADN présent dans chaque cellule et participe à la synthèse des protéines. La photo était magnifique. Woese et Fox ont découvert que les organismes unicellulaires sont plus diversifiés que toutes les plantes et tous les animaux réunis. Il s’est avéré que ce sont des animaux, des plantes, des champignons ; tout le monde, méduses, bousiers ; n'importe quel fil d'algue, n'importe quelle parcelle de mousse, les séquoias de Californie qui s'élèvent vers le haut ; tous les lichens et champignons forestiers - tous les êtres vivants que nous voyons autour - ne sont que trois processus à l'extrémité d'une branche de l'arbre évolutif. Ses principaux habitants sont des organismes unicellulaires : bactéries, archées (qui ont été identifiées pour la première fois comme un groupe distinct par Woese et Fox), levures et quelques autres formes de vie.

Ce n’est qu’au cours des dernières années qu’il y a eu une percée dans la compréhension de la microvie en nous, que nous devons aux nouvelles technologies, notamment à l’amélioration du séquençage de l’ADN et à l’explosion de la puissance des ordinateurs. Aujourd'hui, grâce à un processus appelé séquençage de nouvelle génération, nous pouvons prélever des échantillons de cellules de différentes parties du corps, analyser rapidement l'ADN microbien qu'elles contiennent, le comparer et le combiner avec des informations provenant d'autres organes, pour identifier les milliers d'espèces de micro-organismes. qui habitent notre corps. . Nous découvrons ainsi des bactéries, des archées, des levures et d'autres organismes unicellulaires (notamment les eucaryotes) dont les génomes combinés sont plus longs que le nôtre.

Eh bien, les nouveaux algorithmes informatiques, à leur tour, simplifient et facilitent grandement l’interprétation de cette information génétique. En particulier, nous pouvons désormais créer une carte microbienne du corps, ce qui nous permet de comparer les communautés de micro-organismes dans différentes parties du corps et chez différentes personnes. Une grande partie de ces informations a été obtenue dans le cadre du Human Microbiome Project ( Projet sur le microbiome humain), réalisée sous les auspices des National Institutes of Health des États-Unis ( Instituts nationaux de la santé des États-Unis, NIH). L’étude a coûté 170 millions de dollars et a impliqué plus de deux cents scientifiques qui ont collecté et analysé à ce jour au moins 4,5 téraoctets de données. Et ce n'est que le début; d'autres projets internationaux, comme « Etude de la composition du biote du tractus gastro-intestinal humain » ( Métagénomique du Consortium du tractus intestinal humain, MetaHIT), ajoutant et analysant constamment de nouvelles données.

Le coût de ces tests ne cesse de baisser, grâce auxquels de plus en plus de personnes peuvent faire un recensement complet des microbes vivant dans leur corps. Il y a dix ans, il aurait fallu débourser cent millions de dollars pour faire analyser son microbiome. Aujourd’hui, de telles informations ne coûtent qu’une centaine de dollars – si bon marché que les médecins prescriront bientôt de tels tests dans le cadre d’une procédure médicale de routine.

Mais pourquoi les médecins s’intéressent-ils à la composition de votre microbiome ? Parce que de plus en plus de recherches montrent un lien entre nos microbes et bon nombre de nos maladies, notamment l’obésité, l’arthrite, l’autisme et même la dépression. Et cette connexion, à son tour, ouvre immédiatement de nouvelles perspectives de traitement.

Ce qui n’affecte pas notre microbiome : les médicaments, l’alimentation, le nombre de partenaires sexuels, même si vous êtes le premier enfant de vos parents ! En lisant les pages suivantes, vous constaterez que les micro-organismes sont profondément impliqués dans presque tous les aspects de nos vies. Ils nous obligent vraiment à porter un autre regard sur la question : « Qu’est-ce qu’être humain ?

1. Microorganismes de notre corps

Essayons donc d'estimer combien de microbes vivent à l'intérieur de nous.

Si l'on compte en masse, le corps d'un adulte contient en moyenne environ un kilo et demi. Cela fait de votre microbiote l’un des plus grands organes, rivalisant en poids avec le cerveau et à peine plus petit que le foie.

Nous savons déjà qu'en termes de nombre absolu de cellules, les micro-organismes surpassent les humains dans un rapport de dix pour un. Et si on comparait notre ADN ? Chacun de nous possède environ vingt mille gènes humains. Et en même temps, nous sommes porteurs de deux à vingt millions de gènes microbiens. Cela signifie, hélas, que d’un point de vue génétique nous sommes au moins à 99 % des microbes !

Pour que cela vous soit moins offensant, considérez-le du point de vue de la complexité de la structure humaine. Chaque cellule humaine contient beaucoup plus de gènes que les cellules microbiennes. Il y a tout simplement tellement de microbes dans votre corps que la somme de tous leurs gènes dépasse les vôtres.

Les organismes qui vivent en nous et sur nous sont très divers. La plupart d’entre eux (mais pas tous) sont unicellulaires. Ils représentent les trois branches principales de l’arbre évolutif. Les représentants du royaume des Archées vivent dans les intestins - des organismes unicellulaires qui n'ont pas de noyau ; les plus courants sont les méthanogènes, qui existent sans oxygène, aident à digérer les aliments et produisent du méthane (les vaches en ont aussi).

Viennent ensuite les eucaryotes : champignons mycoses cutanées et levures, qui créent des colonies dans le vagin et parfois dans les intestins. Mais les bactéries dominent partout - par exemple Escherichia coli ( Escherichia coli), E. coli, que nous associons principalement à une indigestion due à des légumes verts mal lavés. Cependant, des variétés inoffensives et bénéfiques de cette bactérie sont presque toujours présentes dans nos entrailles.

Et chaque jour, grâce aux nouvelles technologies, nous apprenons que ce monde est encore plus diversifié qu’on ne le pensait auparavant. C'est comme si nous traversions l'océan avec un chalut à très grandes mailles et qu'après avoir examiné les prises, nous concluions que les seuls habitants de la mer étaient des baleines et des calmars géants. Nous avons maintenant découvert que la vie en nous est beaucoup plus diversifiée. Par exemple, vous pourriez supposer que deux bactéries présentes dans votre intestin qui ont attaqué votre dernier sandwich sont très similaires, comme, par exemple, les anchois ou les sardines. Mais en réalité, ils n’ont rien de plus en commun que l’holothurie et le grand requin blanc : ce sont deux créatures au comportement, à l’alimentation et aux rôles écologiques complètement différents.

Alors, où sont tous nos microbes et quel est leur rôle ? Pour le savoir, faisons le tour de notre corps.

Cuir

On raconte que Napoléon, de retour d'une campagne militaire, écrivit à l'impératrice Joséphine : « Je serai à Paris demain soir. Ne prends pas de bain. Il préférait le parfum naturel de son épouse adorée, et concentré. Mais pourquoi, quand nous restons pendant un certain temps sans savon, déodorants, poudre et parfum, commençons-nous à sentir si mauvais ? Principalement à cause des microbes qui se nourrissent de nos sécrétions et les rendent encore plus odorantes.

Les scientifiques tentent toujours, excusez le jeu de mots, de découvrir à quoi servent les activités des créatures qui vivent sur notre organe le plus étendu, la peau. Une chose est sûre : ils contribuent à la formation de notre odeur corporelle, y compris les composants de cette odeur qui attirent les moustiques. 3
N. O. Verhulst et al., « La composition du microbiote cutané humain affecte l'attractivité des moustiques du paludisme » PlS One 6, non. 12 (2011) : e28991.

Comme nous l'avons déjà noté, les insectes hématophages vraiment Ils préfèrent les odeurs de certaines personnes à celles d’autres, et les microbes en sont responsables. Ils décomposent les substances sécrétées par la peau en composés volatils que les moustiques peuvent ou non apprécier. De plus, différents types de moustiques préfèrent différentes parties de notre corps. Par exemple, pour Anophèle gambiae, l'un des principaux vecteurs du paludisme, le plus attrayant n'est pas l'odeur des aisselles, mais l'odeur des mains et des pieds.

Cela soulève une solution tentante : si vous frottez un antibiotique sur la peau de vos mains et de vos pieds, vous pouvez prévenir les attaques de ce type de moustique, car en tuant les germes, vous tuez l'odeur.

Les microbes qui vivent sur notre peau – comme tous les autres microbes – n’existent pas nécessairement spécifiquement pour notre bénéfice. Mais eux, en tant que résidents consciencieux, nous aident vraiment beaucoup : du simple fait qu'ils vivent sur nous, ils empêchent d'autres microbes nocifs de nous infecter. Différentes zones de la peau sont habitées par différents microbes, et la diversité (le nombre d'espèces) n'est pas nécessairement proportionnelle au nombre de microbes présents dans une zone particulière. Parfois, c'est tout le contraire. Dans une analogie américaine, imaginez que le Vermont (600 000 habitants) soit aussi diversifié sur le plan ethnique que Los Angeles (dix millions d’habitants) et que Los Angeles soit devenue aussi mono-ethnique que le Vermont. Il existe un grand nombre de microbes sur votre front et sous vos bras, mais de types relativement peu nombreux ; et vice versa, sur les mains (paumes et avant-bras) il y a relativement peu de microbes, mais très divers 4
E. A. Grice et al., « Diversité topographique et temporelle du microbiome de la peau humaine », Science 324, non. 5931 (29 mai 2009) : 1190-92 ; E. K. Costello et al., « Variation de la communauté bactérienne dans les habitats du corps humain à travers l'espace et le temps », Science 326, non. 5960 (18 décembre 2009) : 1694-97.

Les communautés microbiennes présentes sur les mains des femmes ont tendance à être plus diversifiées que celles des hommes, et cette différence persiste malgré le lavage des mains, ce qui suggère que la raison, bien qu'encore inconnue, réside dans des différences biologiques. 5
F. R. Blattner et al., « La séquence complète du génome d'Escherichia Coli K-12 », Science 277, non. 5331 (5 septembre 1997) : 1453-62.

De plus, nous avons découvert que les microbes qui vivent sur votre main gauche sont différents de ceux qui vivent sur votre droite. Vous pouvez vous frotter les mains, taper dans vos mains et toucher les mêmes surfaces avec les deux mains : chacun développera toujours une communauté microbienne distincte. Ce fait a inspiré le professeur Noah Firer de l'Université du Colorado à Boulder et moi-même à tenter de reproduire l'une des découvertes les plus célèbres de la biologie générale. À une époque, essayant d'expliquer la répartition et la répartition des organismes sur des îles isolées et la relation entre la diversité des espèces et le territoire occupé, le biologiste et anthropologue britannique Alfred Russel Wallace, avec d'autres scientifiques, a développé une théorie complexe de la biogéographie. 6
R. H. MacArthur et E. O. Wilson, La théorie de la biogéographie insulaire. Princeton, New Jersey : Princeton University Press, 2001.

Wallace, un contemporain de Darwin qui a développé simultanément et indépendamment la doctrine de la sélection naturelle, a tracé une ligne qui traverse l'Indonésie et la Malaisie modernes et sépare la faune asiatique (singes et rhinocéros) de la faune australienne (cacatoos et kangourous). Firer et moi nous sommes demandés si nous pouvions tracer la même « ligne Wallace » sur un clavier d’ordinateur entre les touches G et H – une ligne qui, en théorie, séparerait les moitiés du clavier avec des populations microbiennes clairement distinctes. Nous voulions également voir s'il y aurait plus de types de microbes sur la barre d'espace, simplement parce qu'elle est beaucoup plus longue que toutes les autres.

Nos résultats ont confirmé l’existence d’une sorte de « lignée de Wallace », mais nous avons découvert quelque chose de bien plus surprenant : chaque doigt et sa touche correspondante possédaient à peu près la même communauté microbienne. Nous avons également pu déterminer les propriétaires d'une souris d'ordinateur grâce au profil microbien de la paume avec une précision de 90 %. 7
N. Fierer et al., « Identification médico-légale utilisant les communautés bactériennes cutanées » 107, non. 14 (6 avril 2010) : 6477-81.

La communauté microbienne sur votre main est très différente des communautés similaires d'autres personnes (en termes de diversité des espèces - en moyenne de 85 %), ce qui signifie que chacun de nous, en plus des empreintes digitales habituelles, a également des empreintes microbiennes.

Nous sommes allés plus loin et avons mené des expériences pour déterminer combien de fois un objet doit être touché pour laisser une marque microbienne distincte. Cette recherche est encore trop incomplète pour être utilisée devant les tribunaux. Mais à la télévision, disons, des normes de preuve plus simplifiées sont acceptées, donc peu de temps après la publication d'un article sur ce sujet, un autre épisode de la série « Crime Scene : Miami » a été diffusé, où l'intrigue était basée sur un examen médico-légal de une empreinte microbienne 8
« Scène de crime : Miami » : » Les Experts : Miami Saison 9 », Wikipédia, http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_CSI:_Miami_episodes#Season_9:_2010.E2.80.932011.

Pendant ce temps, le microbiologiste légiste David Carter a déménagé du Nebraska à Hawaï pour y installer un « sanctuaire corporel ». "Ce que c'est?" - demandez-vous. Les criminologues sont souvent confrontés à la tâche de déterminer depuis combien de temps la mort de la personne dont ils examinent le cadavre s'est produite. Dans la « réserve » Carter, les corps des défunts, offerts par les proches et diverses institutions, sont stockés dans des conditions diverses. 9
Pour une introduction très pédagogique et ludique au « jardin de nos corps » voir : Mary Roach, Stiff : la curieuse vie des cadavres humains. New York : WW Norton, 2004.

Et les scientifiques analysent constamment la vitesse de leur décomposition. Dans le même temps, on observe une continuité frappante des communautés microbiennes. Tout comme sur les roches nues apparaissent d'abord des colonies de lichens, puis successivement des mousses, des graminées, des mauvaises herbes, des arbustes et enfin des arbres, le processus de décomposition se déroule également dans un certain ordre.

Jessica Metcalf, postdoctorante dans mon laboratoire à l'Université du Colorado à Boulder, a créé son propre « sanctuaire corporel » miniature en utilisant quarante souris mortes (elles étaient mortes au cours d'autres expériences visant à développer des médicaments pour traiter les maladies cardiovasculaires et le cancer). Jessica a découvert qu'elle pouvait déterminer correctement l'heure du décès dans un délai de trois jours. Il s’agit à peu près de la même erreur que la méthode des insectes actuellement utilisée. 10
Meagan B. Gallagher, Sonia Sandhu et Robert Kimsey, « Variation du temps de développement pour des populations géographiquement distinctes de la mouche verte commune, Lucilia sericata (Meigen) », Journal des sciences médico-légales 55, non. 2 (mars 2010) : 438-42.

Pourquoi alors avons-nous besoin d’une méthode microbiologique ?

Réponse : les insectes n'ont pas encore trouvé de cadavre, alors que les micro-organismes sont toujours là, ce qui peut être utile dans les cas où il n'y a pas d'insectes sur la scène du crime.

Nez et poumons

Le prochain point de notre visite du corps sera le nez. Certains types de microbes vivent dans les narines humaines, notamment Staphylococcus aureus ( Staphylococcus aureus), qui provoque des infections staphylococciques dans les hôpitaux. Ainsi, les personnes en bonne santé semblent souvent héberger des microbes dangereux. Nous pensons que dans ce cas, l'explication pourrait être la suivante : d'autres bactéries vivant dans notre nez ne permettent pas à Staphylococcus aureus de prendre le relais, ou plutôt de prendre le contrôle du nez. Autre observation intéressante : l’environnement influence grandement les types de micro-organismes qui s’installent dans notre nez. Les enfants ayant une population microbienne nasale plus diversifiée, comme ceux vivant dans des zones rurales à proximité d’animaux, sont moins susceptibles de développer de l’asthme et des allergies à l’avenir. 11
O. S. Von Ehrenstein et al., « Risque réduit de rhume des foins et d'asthme chez les enfants d'agriculteurs », Allergie clinique et expérimentale : Journal de la British Society for Allergy and Clinical Immunology 30, non. 2 (février 2000) : 187-93 ; E. von Mutius et D. Vercelli, « La vie à la ferme : effets sur l'asthme et les allergies chez les enfants » Nature Reviews Immunologie 10, non. 12 (décembre 2010) : 861-68.

Il s’avère que bricoler dans la boue est parfois utile.

Lorsque nous descendons dans les poumons, nous ne trouvons généralement que des bactéries mortes. 12
E. S. Charlson et al., « Évaluation des populations bactériennes dans les poumons par analyse répétée d'échantillons des voies respiratoires supérieures et inférieures », PlS One 7, non. 9 (2012) : e42786 ; E. S. Charlson et al., « Continuité topographique des populations bactériennes dans les voies respiratoires humaines en bonne santé »,

La surface interne des poumons, où l’air est exposé, contient un cocktail de peptides antimicrobiens : de minuscules protéines qui tuent instantanément les bactéries qui y pénètrent. Cependant, des micro-organismes dangereux contribuant au développement de maladies pulmonaires se retrouvent parfois dans les poumons de patients atteints de mucoviscidose ou du virus de l'immunodéficience humaine (VIH). 13
J. K. Harris et al., « Identification moléculaire des bactéries dans le liquide de lavage broncho-alvéolaire d'enfants atteints de fibrose kystique », Actes de l'Académie nationale des sciences des États-Unis d'Amérique 104, non. 51 (18 décembre 2007) : 20529-33.

Les scientifiques se demandent encore si chacun de nous possède une communauté distincte de microbes dans la gorge ou s'il existe uniquement des microbes provenant de la bouche. 14
E. S. Charlson et al., « Continuité topographique des populations bactériennes dans les voies respiratoires humaines en bonne santé », Journal américain de médecine respiratoire et de soins intensifs 184, non. 8 (15 octobre 2011) : 957-63.

Cependant, on sait déjà que les microbes présents dans la gorge des fumeurs sont différents de ceux des non-fumeurs, ce qui suggère probablement que fumer est nocif non seulement pour nous-mêmes, mais aussi pour les créatures qui vivent en nous. 15
A. Morris et al., « Comparaison du microbiome respiratoire chez les non-fumeurs et les fumeurs en bonne santé » Journal américain de médecine respiratoire et de soins intensifs 187, non. 10 (15 mai 2013) : 1067-75.

Bouche et estomac

Très probablement, vous n’avez entendu parler que des bactéries buccales nocives, celles qui causent des maladies des gencives et des dents. L'un d'eux, le streptocoque mutans ( Streptocoque mutans), est la même créature qui détruit nos dents. Il est apparu, apparemment, en relation avec le développement de l'agriculture 16
O. E. Cornejo et al., « Génomique évolutive et de population de la cavité causant la bactérie Streptococcus Mutans », Biologie moléculaire et évolution 30, non. 4 (avril 2013) : 881-93.

Lorsque l'alimentation de nos ancêtres était fortement enrichie en glucides, notamment en sucres.

Tout comme les rats que nous avons involontairement domestiqués et nourris de nos déchets, certaines bactéries ont appris à vivre dans notre corps. Heureusement, la plupart des bactéries « domestiquées » sont bénéfiques : elles forment un biofilm qui éloigne les « mauvaises » bactéries. Les microbes buccaux peuvent même aider à réguler la tension artérielle en relaxant les artères grâce à la libération d'oxyde nitrique (un parent de l'oxyde nitreux que vous rencontrez chez le dentiste).

Un autre type, la baguette de Plaut ( Fusobactérie nucléatum), en règle générale, est présent dans la bouche d'une personne en bonne santé, mais peut également contribuer au développement d'une maladie parodontale 17
J. Slots, « La microflore cultivable prédominante de la parodontite avancée » Journal scandinave de recherche dentaire 85, non. 2 (janvier/février 1977) : 114-21.

. F. nucléatum est intéressant car ces bactéries se trouvent à l’intérieur des tumeurs du côlon 18
M. Castellarin et al., «L'infection par Fusobacterium Nucleatum est répandue dans le carcinome colorectal humain», Recherche sur le génome 22, non. 2 (février 2012) : 299-306 ; M. R. Rubinstein et al., « Fusobacterium Nucleatum favorise la carcinogenèse colorectale en modulant la signalisation E-cadhérine/bêtacaténine via son adhésine FadA », Hôte cellulaire et microbe 14, non. 2 (14 août 2013) : 195-206 ; A. D. Kostic et al., « Fusobacterium Nucleatum potentialise la tumorigenèse intestinale et module le microenvironnement immunitaire tumoral » Hôte cellulaire et microbe 14 (2013) : 207-15 ; R. L. Warren et al., « Cooccurrence de bactéries anaérobies dans les carcinomes colorectaux », Microbiote 1, non. 1 (15 mai 2013) : 16 ; L. Flanagan et al., « Fusobacterium Nucleatum s'associe aux stades de développement de la néoplasie colorectale, au cancer colorectal et à l'issue de la maladie » Journal européen de microbiologie clinique et de maladies infectieuses : publication officielle de la Société européenne de microbiologie clinique 33, non. 8 (août 2014) : 1381-90.

Mais on ne sait pas encore s’il s’agit d’une cause ou d’une conséquence : soit F. nucléatum provoque le cancer, ou s’agit-il simplement d’une réaction aux conditions dans lesquelles la tumeur se développe.